Por lo que se ha podido comprobar, al realizar la conversión anterior de las ID de los objetos del archivo 'jobConfig.yml', se han corrompido los permisos asociados a cada trabajo, por lo que se decide empezar de nuevo.

Se vuelve a realizar la conversión de todas las ID de los objetos, utilizando la herramienta
ID Converter
Se eliminan los 'Items' del archivo 'jobConfig.yml', así como lo indica el plugin en la consola.

Se corrigen todos los errores que aparecen en consola.